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枯萎病菌屬于尖孢鐮刀菌，病菌在土壤中存活可達5－6年。病菌從根部傷口及根毛端侵入。在導管中發育，分泌毒素填塞導管，影響水分運輸而引起植株萎蔫死亡。如果在栽培中選用抗病同屬品種如葫蘆、南瓜作砧木進行嫁接，一般可防連作發病。但如果病菌從砧木嫁接口以上的植株傷口進入，也會使植株染病，但病情在防治上就相對比從根部開始感染病害會容易，并且發病程度也會相對減輕。
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