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1.根 黃瓜根系較淺，主要分布在表土7～8厘米，10厘米 內最為密集，主根可深達60～100厘米。側根橫向伸展主要集中在半徑30厘米內。抗旱能力較差，吸肥力較弱。黃瓜根系木栓化比較早，斷根后再生能力較差。幼苗胚軸及莖上有發生不定根的能力，不定根的生長要比原根還要旺盛。
2.莖 莖為五菱，蔓性，中空，有剛毛。莖的機械組織不發達，易折損。莖的長度與類型、品種和栽培條件有關。一般早熟品種莖較短，側枝少，中晚熟品種莖較長，側枝多。莖的粗和節間的長短是診斷植株強健與否的重要依據。
3.葉 葉為掌狀或五角形，葉面積較大，上有刺毛。葉片薄，易受機械損傷。
4.花 黃瓜基本上是雌雄同株異花，也有兩性花出現。腋生，黃色，是蟲媒花，自然雜交率高達70％以上。花期短，開花后5～6小時花柱失去生活能力。
5.果實 果實為瓠果，棒狀，上有棱、線、刺瘤。黃瓜具有單性結實的功能，但授粉能提高結實率。
6.種子 種子扁平，呈橢圓形，黃白色，每條瓜可產100～400粒種子。
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